Совет попечителей состоит из наиболее авторитетных выпускников АУЭС различных специальностей, а также руководителей или уполномоченных в установленном порядке представителей компаний, организаций и предприятий-членов Ассоциации, предлагаемых заведующими выпускающих кафедр и проректорами НАО «АУЭС». В состав Совета попечителей на обязательной основе входят ректор, директора институтов, директор департамента по академическим вопросам без права голоса (Положение у тверждено прик азом рек тора No 35 от 15.03.2019 года). без права голоса.
Количественный и персональный состав Совета попечителей, его срок полномочий определяются Ученым Советом НАО «АУЭС» открытым голосованием. В своей деятельности Ассоциация руководствуется Положением об Ассоциации выпускников, а также иными локальными актами АУЭС и действующим законодательством РК.